細胞番号 : 細胞名 RCB5383 : COLO 320DM#3 SIRT1 KO cl.3  update : 2024/01/17
細胞特性(Comment:英)
細胞特性(日)
細胞特性(寄託者記述:英)			Human colorectal carcinoma COLO 320DM #3 strain was cloned from the ATCC strain by Von Hoff Laboratory at Texas University around 1990. The strain was used by Shimizu Laboratory at Hiroshima University for development and application of the IR/MAR gene amplification methodology. The strain was further delivered to Mirit I Aladjem Laboratory at US NIH, where the SIRT1 knocked-out clones were isolated. Shimizu Lab in collaboration with Aladjem lab found that the genes amplified in these clones were expressed at very high level.
細胞特性(寄託者記述:日)			ヒト大腸がんCOLO 320DM #3株は、ATCC株からテキサス大学のVon Hoff Labで、1990年前後にクローン化された細胞株である。本株は、広島大学のShimizu Labで、IR/MAR遺伝子増幅法の樹立と応用に用いられた。更にその細胞株から、 米国NIHのMirit I. Aladjem Labで、SIRT1 遺伝子がKOされたクローンが単離された。清水研究室はAladjem研究室と共同で、このKO細胞クローンで増幅された遺伝子は、非常に遺伝子発現が高まっていることを見いだした。
使用条件(英)			1) When publishing research results, the user should cite the literature designated by the depositor (Cancer Res 2001 61(19):6987-90) regarding the IR/MAR gene amplification method. Regarding the increased expression of the amplified gene in the SIRT1 disruptant, please cite the document designated by the depositor (J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100356). 2) The RECIPIENT of BIOLOGICAL RESOURCE shall obtain a prior written consent on use of it from the DEPOSITOR. 3) There is no restriction, if RECIPIENT use the BIOLOGICAL RESOURCE only for publication of research papers.
使用条件(日)			1) 利用者は、研究成果の公表にあたって、IR/MAR遺伝子増幅法については、寄託者の指定する文献 (Cancer Res 2001 61(19):6987-90)を引用すること。SIRTl破壊株では,増幅した遺伝子からの発現が増加することについては、寄託者の指定する文献 (J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100356)を引用すること。2) 利用者は寄託者から事前に提供承諾書を取得すること。3) 学術研究に利用の制限は設けない。
備考(英)			CRISPR/Cas9 genome edited bioresources Announcement of bioresources developed by the CRISPR/Cas9 technology.
備考(日)			｢CRISPR/Cas9 テクノロジーを用いて開発されたバイオリソースに関するお知らせ｣を必ず確認すること。
承諾者住所			× Japanese 住所 739-8521 広島県 東広島市鏡山一丁目7番1号 広島大学   清水 典明 先生 Fax. 082-424-0759 English Address Hiroshima Universitye School of Integrated Arts and Sciencese 1-7-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima City, 739-8521 Dr.Shimizu Noriaki Fax. +81-82-424-0759
提供申込書類(英)			Order Form(C-0005.pdf)   Approval Form(C-0006.pdf)   MTA(C-0065.pdf)
			Regarding MTA between user institutions and RIKEN BRC, there are two kinds of MTA, not-for-profit academic purpose (C-XXXX) and for-profit research purpose (C-XXXXp) , depending on the sort of user institutions and the purposes of use. Please use an appropriate MTA(to see). In relation to commercial use and use for patent filing, first of all Please contact RIKEN BRC (cellbank.brc@riken.jp).
提供申込書類(日)			依頼書C-0001.pdf   承諾書C-0002.pdf   同意書C-0064.pdf
			提供同意書は、使用機関の種類や目的に応じて、非営利学術目的 (C-XXXX) と営利目的 (C-XXXXp) の2種類があります。該当する提供同意書をご使用ください（詳細）。特許等の取得及び商業利用等は事前に必ず cellbank.brc@riken.jp までご連絡ください。
提供手数料			手数料とお支払いについてはこちらをご覧ください。
細胞基本情報		寄託者	SHIMIZU, Noriaki
		樹立者	SHIMIZU, Noriaki
		寄託日	2021
		元の細胞	COLO 320DM
		クローニング（寄託者）	Yes
		クローニングの時期（寄託者）	2016
		クローニングの方法（寄託者）	limiting dilution
		動物種	_human < Mammals
		属名	Homo
		種名	sapiens
		人種	Caucasian
		性別	Female
		齢	55 years
		採取組織	colon
		病名	colorectal carcinoma
		腫瘍	neuro-endocrine origin
		細胞分類	cancer
		遺伝子改変	recombinant
		外来遺伝子	pCas9-SIRT1 plasmid
		選択用添加物と濃度	puromycin
		遺伝子組み換えウィルスの産生	No
		細胞寿命	infinite
		細胞形態	other (rounded and refractile)
		Cellosaurus(Expasy)	CVCL_A6UM
細胞培養・検査情報			寄託時情報	ロット情報
	培地・試薬情報		培地・試薬一覧はこちらをご覧ください。
		培養形態	rounded and refractile	Adherent/Suspension cells
		培地	RPMI 1640 +10%FBS	RPMI1640 + 10% FBS
		抗生物質		Free
		継代方法		pipetting
		播種細胞数	3x10 5 cells /ml	3x10 5 cells /ml
		継代・培地交換頻度	once/3-4 days	Subculture : twice/week
		培養最適温度	37 ℃	37 ℃
		二酸化炭素濃度	5 %	5 %
		凍結培地	liquid nitrogen :Liquid nitrogenMedium + 10% DMSO, -80℃ : Cell Banker I	Medium + 10% DMSO
		凍結方法		Slow freezing
		マイコプラズマ		(-)
		動物種PCR		OK
		飽和密度	2-3x10 6 cells/ml
		倍加時間	24 hr
		コロニー形成率	〜80 %
		その他	The cell may form aggregattion.
		個体識別検査		OK
文献情報		Reference(英)	3件
		Reference(日)	0件
		利用者成果(英)	0件
		利用者成果(日)	0件

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Reference(英)

3262  Ryonosuke Taniguchi, Koichi Utani, Bhushan Thakur, Kazuho Ishine, Mirit I Aladjem, Noriaki Shimizu   SIRT1 stabilizes extrachromosomal gene amplification and contributes to repeat-induced gene silencing  J Biol Chem  2021    PubMed ID: 33539925   DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100356

3246  Noriaki Shimizu, Toshihiko Hashizume, Kenta Shingaki, June-ko Kawamoto  Amplification of plasmids containing a mammalian replication initiation region is mediated by controllable conflict between replication and transcription  Cancer Res  2003  63(17):5281-90  PubMed ID: 14500359

3223  N Shimizu, Y Miura, Y Sakamoto, K Tsutsui  Plasmids with a mammalian replication origin and a matrix attachment region initiate the event similar to gene amplification  Cancer Res  2001  61(19):6987-90  PubMed ID: 11585721

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